Для того, что бы установить один счетчик для домена и субдомена потребуется регистрация именованного счётчика. Перейдите по ссылке:
www.liveinternet.ru/add?type=account
И зарегистрируйтесь. после этого установите данный счетчик на домен и субдомен (Если уже был обычный счетчик, то замените его)
Подробнее можно прочесть вот тут: www.liveinternet.ru/help/group.html